病人一般可在栓塞24小时后出现高烧达39℃以上，可能是由于肌肉和组织破坏所致;栓塞物可通过瘘口，进入肺动脉引起肺栓塞;如操作时无菌术掌握不严，可并发败血症;静脉淤滞可继发血栓形成，可导致肺栓塞。先天性动静脉瘘属良性病变,却具有恶性肿瘤的生物学行为,病变部分不断发展、蔓延,常广泛侵犯邻近组织和器官,如肌肉、骨骼、神经等,直至蔓延到整个机体及躯干。

少数因瘘口大而病程长的患者，可并发心力衰竭。由于动脉之间短路，周围血管阻力明显下降，使心每搏输出量明显增加。此外，尚通过肾上腺素、血管紧张素、醛固酮系统兴奋引起钠、水潴留和组织蛋白的动用，血容量增加，心脏负担加重，从而导致心力衰竭。