左侧心包部分缺损可因在缺损处发生一部分心脏的嵌顿疝的形成，导致心脏泵血功能出现异常，如血压下降、心力衰竭、肺水肿等严重的并发症，而危及生命。右侧部分心包缺损异常罕见，可伴有吸气时右胸痛，是由于右心房或右心室疝或肺疝进入心包腔。
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