阴道横隔的鉴别诊断：
应与处女膜闭锁相鉴别。根据症状以及妇科检查不难鉴别。但如完全闭锁时，其症状与处女膜闭锁大同小异。
处女膜闭锁：处女膜孔的形状、大小和膜的厚薄，因人而异。一般处女膜孔位于中央，呈半月形，偶有出现中隔，将处女膜孔分割为左右两半，称中隔处女膜或双孔处女膜。也有膜呈筛状，覆盖于阴道口，称筛状处女膜。如处女膜褶发育过度，呈无孔处女膜，即为处女膜闭锁，是女性生殖器官发育异常中较常见的。
在检查发现阴道横隔时，首先要注意机工隔上(常在中央部位)有无小也，有孔隙者可用探针插孔内，探查小孔上方阴道的宽度及深度以明诊断。