放射治疗是有争论的，有主张阴茎癌仅行放射治疗，由于大量照射可引起尿道狭窄、尿瘘、阴茎坏死和水肿等并发症，应用受到限制。阴茎癌感染、坏死也可降低放疗效果。早期阴茎癌可在博来霉素配合下行X线照射，效果良好。

阴茎癌的预后与肿瘤分期：治疗早晚，治疗方法，患者年龄及肿瘤恶性程度有关。I期阴茎癌手术后患者约3／4存活5年，临床诊断为I期者5年生存率下降至1／2。对已有转移并行腹股沟淋巴清除术者5年生存率仅约l／3。