1.阴茎梅毒 阴茎头部及包皮处无痛性溃疡，肉芽呈紫红色，边缘高起发硬，与阴茎癌早期表现相似。但有冶游史，血清梅毒螺旋体血凝试验(teponema pallidum hemoagglutination)TPHA试验阳性，溃疡分泌物暗视野检查可以查到梅毒螺旋体。

2.阴茎结核 病变多位于阴茎头、系带和尿道外口处。约2/3开始即为溃疡，边缘清楚，溃疡底覆有一层干酪坏死组织，其下为新鲜肉芽组织。约1/3开始为结核结节，逐渐发展成为溃疡，部分可形成瘘管。若病变累及阴茎海绵体并发生纤维瘢痕可使阴茎弯曲。分泌物涂片、培养或动物接种，检出结核杆菌或局部活组织检查为结核病变。

3.阴茎阿米巴病 阴茎头部溃疡，表面出血，有分泌物，可误认为阴茎癌早期。但溃疡渗出物及局部活组织检查可以发现阿米巴原虫及阿米巴包囊。

4.软性下疳 本病病原体为杜克雷链杆菌，经不洁性交感染。常发生于阴茎头或会阴部，开始为小红色丘疹，继而变为脓疮，扩大、破溃，形成卵圆形或圆形溃疡，深浅不一，有轻度触痛，严重者发生阴茎坏死。腹股沟淋巴结可肿大、疼痛、化脓、溃破。杜克雷菌苗皮肤试验阳性，分泌物直接涂片或培养可检出杜克雷菌。

5.凯腊增殖性红斑 阴茎头及包皮处有界限明显的深红色的圆形片状的斑块，亦有硬结或溃疡者，常误认为是阴茎癌的癌前期病变，但病理学检查表现为表皮棘层细胞不良型增生，真皮内有淋巴细胞浸润。

6.阴茎博温病 为阴茎头部鳞状丘疹斑或红色鳞屑斑，界限清楚，或有浅表溃疡与阴茎癌早期不易鉴别。应用连续切片的病理组织学检查，位于表皮内时期的鳞状细胞癌为博温病，癌细胞侵入真皮，则为阴茎鳞状上皮癌。

7.阴茎角化症 阴茎角化症的早期阴茎头部出现硬结，逐渐高起长大脱屑，但不破溃。病理组织学检查可见乳头状鳞状上皮细胞团块，有许多棘细胞，基膜肥厚。

8.阴茎尖锐湿疣 阴茎冠状沟处病毒感染后引起上皮细胞增生的瘤样病变，可形成溃疡，与阴茎癌早期相混淆。但病理组织学检查可见上皮呈乳头状增生，表皮向下延伸，棘细胞层增厚，有多数核分裂。但没有细胞的不典型性和多形性生长，更没有浸润性生长。

9.阴茎乳头状瘤：本病是阴茎较为常见的良性肿瘤。初起为一小的局部隆起，渐增大呈乳头状，有蒂或无蒂，呈红色或淡红色，质较软，生长缓慢，继发感染者可有恶臭样分泌物，易误为阴茎癌。通过活检可作出鉴别。

10.阴茎角：属一种慢性增殖性疾病。局部突起呈条状、柱状生长，灰褐色或黄色，边缘清楚，或干硬如羊角，或头缩尖锐。虽呈增生性组织改变，但无癌细胞生长，赖病检可资 鉴别。

11.阴茎硬结症：本病多发于阴茎海绵体，以局部纤维结节为主。虽肿块坚韧，境界不清，但较癌变肿块硬度差，增长亦缓慢，且表面光滑，有一定活动性，并很少形成溃疡及腹股沟淋巴结肿大。与阴茎癌不难鉴别。