1.良性并发症 胰石病可导致胰腺组织发生慢性炎性改变，产生慢性胰腺炎和胰腺假性囊肿。当炎症累及胰岛细胞时可产生糖尿病。其他并发症有消化性溃疡和肝病。

2.恶性并发症 主要是胰腺癌。综合国内外报道其发病率一般在3.6%～16.7%。有人认为胰石病可导致胰腺组织反复发生慢性炎症和囊肿纤维化，后二者长期作用可使胰腺细胞的基因发生突变，最终发生癌变。从好发年龄来看，胰石病合并胰腺癌的病人以30～40岁居多，而一般胰腺癌以50～60岁居多，前者较后者提前了20岁。