本征常合并眼部及全身先天异常。先天异常的发生率约为正常人群的20倍，有人报道有30%～50%患者伴有眼、骨骼、耳及神经组织的先天缺损。

1.眼部并发症 味觉-泪反射(gusto-lacrimal reflex)或称先天性鳄鱼泪(congenital crocodiletears)。上睑下垂、下睑外翻、色素痣、角膜皮样囊肿、圆锥角膜、小眼球、瞳孔不等、永存瞳孔残膜、虹膜异色、虹膜缺损、先天性白内障、永存玻璃体动脉、视神经盘移位、有髓神经纤维、辐辏功能不足、眼震等。

2.全身并发症 听力障碍、外耳畸形、面神经麻痹、腭裂、齿畸形、脊柱异常、手脚畸形、Golden-hal综合征又称眼-耳-脊柱发育异常(结膜下皮样囊肿、耳有附件、脊柱发育异常)、Horner综合征等。