牙龈萎缩分为生理性萎缩和病理性萎缩两类，随着年龄的增长也会或多或少发生萎缩，使牙根暴露，这种叫生理性萎缩，是不需治疗的，但可以通过保健延缓。病理性萎缩主要由以下几种原因导致：
炎症性牙龈萎缩
龈缘部分存在异物(牙石)又长期得不到清理，细菌滋生刺激所致。这种萎缩最常见，主要是因为牙周炎导致牙周组织遭到破坏，牙槽骨吸收以后，附着在牙槽骨上的牙龈也就随着向牙根方向萎缩，只发生于患有牙周炎的患者。
机械性牙龈萎缩
主要是由于牙刷不符合标准，方法不正确(如横刷法)，不良修复体等机械摩擦或压迫牙龈，造成牙龈和牙槽骨退缩。多发生于一组牙或个别牙。
废用性牙龈萎缩
主要由于牙齿没有了咀嚼功能，牙周组织缺乏必要的功能刺激，长期处于废用状态，可使牙龈，牙槽骨吸收。此种牙龈萎缩就如同一个人长期卧床，不进行行走活动，肌肉就会发生萎缩，这是相同的道理。
早老性牙龈萎缩
和老年人生理性牙龈萎缩相似，大部分或全口牙齿的牙龈和牙槽骨发生萎缩，但多发生于较年轻的青年人。也就是说年轻人出现老年人牙龈萎缩的表现，所以称为早老性牙龈萎缩。据最新的一项调查发现，年轻人过早的出现牙龈萎缩，认为是由于饮食或生活环境污染因素影响而导致牙龈萎缩(食物中含的激素、添加剂等)和药物导致导致牙龈萎缩。