关节镜手术的主要并发症是感染，血管、神经损伤，滑膜炎和少见的关节漏液。感染率低于0.5%，神经损伤低于0.1%，血管损伤少有报道。

由于手术的注液，膝部肿胀最常见。关节积血通常由于外侧松解、半月板修补、入口部位浅层血管出血造成。奈动脉损伤少有报道，但必须引起重视。当出现神经损伤时除去止血带麻痹或局部水肿压迫外还应考虑是否在修补半月板时将神经结扎，此时可手术探查。