碘致甲状腺功能亢进相对有自缓性，治疗必须停止摄碘，由于甲状腺碘贮存和血浆碘增加，甲状腺功能亢进往往持续数周至数月，甲状腺功能亢进可以自然缓解，轻者可单用β阻滞药，重者应用抗甲状腺药物，外科手术一般不需要，由于甲状腺摄碘率低，不宜行放射性碘治疗，胺碘酮所致甲亢可能存在抗甲状腺药物治疗抵抗，同时服用高氯酸钾(1g/d)与抗甲状腺药物，可促使甲状腺内蓄积的碘排出，有利碘致甲状腺功能亢进的治疗，但也有不同的报道结果，成功的治疗可能要延长治疗时间，也有仅使用甲巯咪唑而不停用胺碘酮的成功报道，尽管大多数胺碘酮所致甲亢为高碘所致，少数可发生甲状腺炎，表现为低吸碘率和血浆白介素-6水平升高，此类病人用糖皮质激素效果可能优于抗甲状腺药物。

由于碘具有诱发甲亢的特性，因此在防治地方性甲状腺肿时，碘的用量应适当，尤其甲状腺有结节者更需注意，对非缺碘性结节性甲状腺肿者，应避免使用碘剂，对长期服用胺碘酮者应注意随访。碘甲亢中近一半的患者停药后可自愈，平均时间约为5.5个月，如果症状不缓解，可加用抗甲状腺药物，剂量同普通型甲亢者，必要时需手术切除功能亢进的结节。