可出现感觉障碍，运动障碍，反射异常，脊膜刺激症状。可合并大小便失禁等。脊索瘤发生在胸椎，肿瘤可侵犯相应部位椎体结构，经过椎间孔突入胸腔，破坏肋间神经，引起节段性灼性神经痛。情况严重的话，还会引起肺部胸膜刺激症状，破坏肋间神经可引起节段性灼性神经痛。甚至可引发肺部胸膜刺激症状。
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