主要是鉴别小螺菌病例与链杆菌病例。此外，应与疟疾、慢性脑膜炎菌血症、野兔热、猫抓热、立克次体病及川崎病相鉴别。

两种鼠咬热病例的鉴别诊断

​小螺菌病例链杆菌病例潜伏期较长(1～4周)链杆菌病例较短(7～10天之内)出现，全身症状时咬伤处可见红肿、溃疡咬伤处不再出现病态发热多间歇性多持续性游走性、多发性关节炎较少见多见(约50%)假阳性梅毒血清反应多见(50%)少见(15%)。