为防止继发性营养缺乏病的发生，除了要对导致营养缺乏病发生的疾病进行积极治疗外，还应做好营养指导和病人饮食的管理要针对病人的具体情况供应足够的营养素和热能，由于许多药物可影响营养素的吸收和利用，因此在选用治疗药物时对某些营养素的供给也应予以补充。
营养缺乏病的治疗宜采取综合措施，除针对疾病本身提供合理膳食适当补充相应的营养素制剂外，还应积极消除诱发营养缺乏病的因素方能奏效。
因膳食中营养素供给不足引起的轻度营养缺乏病，应采取饮食治疗为主营养素制剂，补充为辅的原则在饮食治疗中宜采用富有营养的平衡膳食对中度或重度营养缺乏病，由于营养素长期供给不足在临床上常表现为多种营养素同时，缺乏而且还表现为多系统功能衰竭因此对中度或重度营养缺乏，病患者除提供高蛋白高热量高维生素膳食外，还宜采用半流质或流质饮食和少量多餐的原则，以利消化吸收和利用还应针对病情补充，较大剂量的营养素制剂对消化系统功能，严重衰竭的患者在必要时还应考虑采用全价合成营养制剂或肠胃道外给养。
