心内操作要轻巧，于升主动脉阻断前不宜过多地搬动心脏，严防瘤屑脱落。选择好心脏的切口至关重要，切口要够大，才能显露好术野，较易完整地取出肿瘤，而不致于因分离瘤体或心内操作困难，使瘤组织脱落产生瘤栓。瘤体摘除后应常规用吸引管彻底吸除心腔内积血及可能残余的碎屑，以免产生瘤栓并发症。瘤蒂或瘤体附着在心壁的部位，应做较大范围的切除，以免复发。瘤蒂如附着在右心房间隔上，应尽量切除较广泛的房间隔组织。附在房室壁上的肿瘤，只能将心内膜做较广泛的切除，不宜切除更多的心肌组织。肿瘤切除后，如局部的缺损较大，要用涤纶片或自体心包片修复。右心室黏液瘤累及三尖瓣叶的机会较少。左心室腔内低位的黏液瘤常累及乳头肌或非常挨近瓣叶，有的已累及瓣叶的黏液瘤术后需做瓣环成形术或人工瓣膜置换术。