鉴别诊断需与着色芽生菌病和透明丝孢霉病作鉴别。有时需与着色芽生菌病和透明丝孢霉病作鉴别。具体可通过辅助检查进行疾病鉴别。

       真菌学检查：取各种不同损害处脓液和组织液，以10%氢氧化钾溶液处理后，镜下可见各种不同形态棕色和黑褐色菌丝与酵母样孢子，未见厚壁孢子（壁砖状体）。取组织和脓液培养，可生长出褐色和黑色绒毛样或酵母样菌落。

       HE染色中可查到多数分隔、黑色壁的菌丝，直径为1.5～3μm，偶见可分支或酵母样芽生孢子，菌丝周围有炎性细胞或多核巨细胞浸润，无厚壁孢子（壁砖状体）。

       活检时可见皮下组织有稀薄脓液，囊肿内有渗出液，若囊肿壁切除不全、留有窦道。