栓塞：因为非细菌性血栓性心内膜炎的非细菌性赘生物较脆，病变也表浅，一旦脱落可产生动脉栓塞。如脑栓塞可出现偏瘫;冠状动脉栓塞可引起心肌缺血或心肌梗死;肾动脉栓塞可产生肾绞痛等。但由于本病中非细菌性赘生物的较小，所形成的血栓也较小，使多数病例虽有血栓但无明显临床症状，造成生前的漏诊。
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