并发症有高度营养不良、肺部继发感染、癫痫持续状态或心力衰竭等。自然过程常于6～9个月以内死于毒血症，脑膜脑炎可发生在早期，且进展迅速，但也有典型的睡眠病症状,尚未出现即死亡者。舞蹈病样动作与共济失调多见于儿童，随病情进展出现肌强直，嗜睡，继之昏睡，昏迷，并伴有全身瘙痒，此阶段脑脊液检查可见白细胞计数增加，末期多死于高度营养不良，肺部继发感染，癫痫持续状态或心力衰竭等。