主要与肝腺瘤鉴别，因后者常有并发症，肿瘤易破裂出血，常需手术治疗。两者主要鉴别是依据病理学检查。
肝腺瘤亦称肝细胞腺瘤(hepatocellular adenoma，HCA)，是较少见的肝脏良性肿瘤，究其原因可能与应用避孕药的增加有关，据报道长期服用避孕药者该病的发病率为(3～4)/1万，而在不服用避孕药及服用避孕药史短于2年的妇女，该病的发病率仅为1/100万，肝腺瘤可为单发性或多发性，而胆管囊腺瘤可发生恶性变。