X线检查：由于现代许多影像检查如超声、CT均普遍应用，且显示软组织病变优于传统X线。但后者对诊断虹膜囊肿仍具有特征性。
超声检查。
CT扫描：CT扫描在虹膜囊肿的诊断中具有重要位置。
MRI：MRI对虹膜囊肿的诊断如同其他眼眶良性肿瘤一样，T1WI呈中信号，T2WI为高信号，但部分肿瘤T2WI信号较低，呈中信号。由于扫描多个角度而使对肿瘤的空间位置了解地更清楚增强后扫描显示肿瘤明显增强。