1.输尿管结石：输尿管结石引起的绞痛常与精囊结石排出过程中阻塞射精管时阻碍精液排出引起下腹部、腹股沟处疼痛相似。但疼痛与射精无关，腹部X线平片及尿路造影在输尿管径路上可发现不透光阴影。

2.精囊结核：精囊结核钙化阴影与精囊结石在X线平片上表现相似。而精囊结核具有泌尿系及身体其它部位结核病灶的病史，病变可向前列腺周围溃破，在会阴部形成窦道。附睾常受累及，肿大变硬，有不规则结节。输精管呈串珠状硬结改变。前列腺精囊液或精液涂片或结核杆菌培养可以发现结核杆菌;前列腺活组织检查可见典型的结核病变。