血培养(包括厌氧菌培养至少2次)，按感染可能发生的部位取痰、尿、鼻咽部分泌物、粪、脑脊液、创口分泌物等做细菌培养及药物敏感试验。取血清进行血清学试验(比较好取急性期、恢复期两份标本)。为防止污染，比较好作气管穿刺或用纤维支气管镜取痰，耻骨上缘穿刺取尿进行培养。
必要时，尚需做X线检查、内镜检查、免疫学检查、活组织病理检查等，有助于及时确诊。