病理病因分为器质性病因和非器质性病因两种：

器质性病因：茎突过长、颈椎病、上呼吸道慢性炎症、咽肌食管肌痉挛、反流性食管炎 、食道裂孔疝及胃病、咽喉及扁桃体病变、慢性鼻窦炎、环杓关节炎、咽、喉、食管、贲门部癌肿早期等等。

非器质性病因：年龄30～40岁发病率较高，女性患病率高于男性，常见有咽喉神经官能症、癔病、疑病性神经症、精神分裂症等。

梅核气主要因情志不畅引起，因此细心开导、解除其思想顾虑，有益于疾病痊愈。此外，也应少食煎炒辛辣食物。