本病需与其他细胞免疫缺陷病相鉴别，本病仅对白色念珠菌和少数抗原相关性真菌缺乏反应，而对病毒、细菌和其他微生物的免疫则正常。

皮肤念珠菌病的鉴别诊断：

1、尿布皮炎为尿布上的大小便浸渍所致。多局限于接触尿布的部位。以红斑、丘疱疹为主要皮损。

2、滴虫性阴道炎阴道黏膜因发炎而鲜红，有假膜样斑点，引起泡沫状分泌物及灼热和痒感。直接镜检真菌阴性。

3、黏膜扁平苔癣在黏膜上有针尖至粟粒大小的乳白色丘疹，成不规则排列。可并发皮肤扁平苔癣。真菌检查阴性。