Kottmeier报道宫颈透明细胞癌的5年生存率为55%，阴道透明细胞癌的5年生存率为30%～50%。Senekjian报道透明细胞癌的5年生存率：Ⅰ期阴道及宫颈透明细胞癌为90%，Ⅱ期阴道及Ⅱa期宫颈透明细胞癌为82%，Ⅱb期宫颈透明细胞癌为60%，Ⅲ期宫颈透明细胞癌为37%，总的5年生存率为80%。影响预后的因素如下：

1.肿瘤大小、范围及深度 直径>3cm或浸润深度>3mm者，易于转移及复发。

2.淋巴结及远处转移 远处转移者预后差，Herbst等报道肺转移的5年生存率仅11%。

3.复发 文献报道346例患者的复发部位：盆腔60%，阴道44%，宫颈8%，膀胱8%，直肠3%，肺36%及锁骨下淋巴结20%。复发病例的预后差，但如复发限于阴道局部，则疗效较好。Herbst等报道局部复发者治疗后，5年生存率可达40%。