原发肺感染应注意与感冒，支气管肺炎等相鉴别。
继发性感染应注意与结核、肿瘤及其它真菌感染、梅毒相鉴别。黏膜及全身各脏器均可受累，但一般不累及肌肉及消化道、肺，重者可致死。分原发性球孢子菌病，和继发性球孢子菌病等。真菌镜检可见圆形厚壁孢子称球体，其中可充满内孢子，真菌培养为双相菌，注意合理的鉴别。
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