有的EP大体形态可误诊为棘皮病或疣状鳞癌，需由组织学进行鉴别，故对EP提倡取活检。

X线配合内镜活组织病理检查可明确诊断。内镜下绝大部分EP呈球形或半球形隆起，多半无蒂，呈浅桃红色，质软，弹性尚可，大小约0.4～0.6cm，罕有超过1cm，多为单个，常位于食管中下段。内镜下如见上述表现，应高度怀疑本病。少数EP为扁平状隆起，呈白色，或因充血、糜烂而呈红色。与HPV有关的EP则较多见于食管上段并呈多灶性。