肾脓肿通常是由于急性肾盂肾炎继续发展，发生坏死并形成含有脓液的腔。糖尿病和感染性结石通常是肾脓肿发病的潜在因素。偶尔肾囊肿继发感染也可形成肾脓肿。肾包膜下脓肿可发展为肾周脓肿，然而肾脓肿与肾周脓肿比较起来，单独存在的情况更少。致病菌通常是Gram阴性杆菌。金葡菌肾脓肿可继发于其他部位感染引起的葡萄球菌败血症。
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