胃梅毒无特异症状，诊断较困难，依据以往疾病史，初期梅毒下疳病史及胃X线检查，血清抗原反应，有助于确诊，胃镜所见及活组织检查符合梅毒的病理改变，可确定诊断，经抗梅毒治疗后，胃部X线钡餐造影显示病变好转或消失，对诊断亦有帮助。

胃梅毒有时与胃癌及胃溃疡难以鉴别，但胃梅毒多发生于未经抗梅毒治疗的年轻患者，病程较长，体重下降较胃癌缓慢，有时须经活组织检查或手术后病理检查方能确诊。