1.尖锐湿疣 显微镜下所见，肿瘤呈多种乳突叶状，缺乏连接核心，犹如尖锐湿疣特征。外阴疣状癌的大体和镜下表现类似Brschke-Loewenstein巨大湿疣，它们可能代表同属一类疾病。

2.良性尖锐湿疣 需做病灶及底部充足活检，以区别疣状癌与良性尖锐湿疣。

3.鳞状细胞癌 以病理活检区别疣状生长方式的鳞状细胞癌。

4.疣性癌 疣状癌也应与疣性癌区别。疣性癌的钉脚尖，形成不规则癌巢，属弥漫性浸润，且可有挖空细胞，以及检测HPV的DNA常阳性。而疣状癌为推移性浸润。两者生物学行为也不同。

5.寻常疣 临床上注意与寻常疣等鉴别。