脊索瘤是来自胚胎脊索的残余，退化的脊索通常都嵌入蝶骨和枕骨内，但部分可向腹侧折入咽壁，其与咽部上皮融合处的细胞有迅速增长的潜力，在某些诱因的作用下，如：放射线影响、毒性药物刺激尤其是对免疫功能有抑制作用的药物等影响，可形成脊索瘤，是一种罕见的低度恶性肿瘤。
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