原发性肺动脉高压的症状和体征均是非特异性的，只能提示有肺动脉高压的可能。结合胸部X线、肺功能及动脉血气检查，基本可除外继发于肺实质性疾病肺动脉压升高，如慢性阻塞性肺疾病、肺间质纤维化等。放射性核素肺通气/灌注扫描和肺动脉造影检查基本可排除较大块的肺血栓栓塞。超声心动图和右心导管检查对继发于心脏病的肺动脉高压可以排除。通过以上检查，肺动脉高压的原因仍不能明确者，临床上可诊断为不能解释的肺动脉高压，主要包括致丛性肺动脉病(真正的原发性肺动脉高压)、多发性肺血栓栓塞及肺静脉堵塞病等。它们之间的鉴别，虽肺灌注扫描可给予一定帮助，但唯一可靠的方法是开胸肺活检，做病理形态学诊断。

原发性肺动脉高压属致丛性肺动脉病，早期病变可能可逆，经治疗有好转的可能;晚期多进行性发展，治疗困难。因此，早期诊断，早期治疗对预后十分重要。

如上述，该病误诊相当普遍，根据我院的资料，被误诊为先天性心脏病者达35%，包括心房间隔缺损、肺动脉瓣狭窄、动脉导管未闭、法洛三联症及艾布斯坦畸形等;误诊为后天性心脏病者占36%，包括风湿性心脏病、冠心病、心肌炎、心肌病及心包炎等;误诊为胸肺疾病者占12%。以上可见，凡能引起右心增大的心肺疾病均有可能与原发性肺动脉高压进行鉴别，只要在实践中提高对原发性肺动脉高压的认识，按着一定的诊断程序，排除所有的继发性肺动脉高压，临床诊断不能解释的肺动脉高压也不是很困难的。