原发性骨淋巴瘤的临床表现多种多样，一般仅表现为局部的病变，而无全身的症状。患者多述局部的骨痛，皮肤肿胀，活动障碍，或触及肿块,肿块呈进行性增大，少数病人表现为病理性骨折。本病的临床表现，病情的轻重，病程的发展在各例差别较大，多和病变部位，病期与并发症有关。

骨痛为最多见的临床表现，大部分的患者仅有骨骼系统的浸润而表现为单纯的骨痛，约1/3的病人有2处或2处以上的病变，1/3的病人只有1处病变。部分病人既表现为骨痛，同时又有局部软组织的肿胀和疼痛。还有一小部分的病人先有局部软组织的改变，后才有骨骼的病变。

长骨是病变最常见的部位。最多发的部位为股骨，髂骨，脊椎骨，上颌骨，肋骨，下颌骨等。

本病的临床表现为非特异性，对于局部骨痛，周围软组织肿胀，或局部触及肿块，易发生病理性骨折的患者，可怀疑本病。骨骼扫描阳性，MRI显示占位性病变,在进行骨骼活检前应考虑原发性骨淋巴瘤的可能性，以便采取足够的材料进行病理检查。确诊需要病理活检。但是，手术活检会增大病理性骨折的可能性。大部分原发性骨淋巴瘤表现为IE期(60%)，Ⅳ期(40%)。