扁桃体切除术虽属耳鼻喉科最常作的手术之一，仍不可以轻视，稍不注意，会给病人带来并发症或其他意外，故手术过程中必须注意以下事项：
1.局麻手术时要注意将麻药注射于扁桃体包膜外，如此麻醉效果好，又易于剥离。手术过程中并需密切观察病人，注意有无麻醉药物的过敏现象。
2.剥离扁桃体上极时要注意，不可剥入扁桃体实质。因为一经进入扁桃体实质，容易出血，导致零星切取，极易遗留残体，手术甚为困难。若发现已剥离入实质，则可从原切口处看清粘膜与扁桃体被膜之间的界限，重新开始剥离，剥离时要紧贴被膜，以避免损伤肌肉。
3.用圈套器摘除扁桃体时，以抓钳将扁桃体抓牢，以防止扁桃体脱落，阻塞声门，造成窒息。
4.扁桃体切除后，要仔细检查扁桃体窝有无扁桃体残留及出血。
5.全麻扁桃体切除术要注意保持呼吸道的通畅，以防止窒息。
