一般的齿龈增生症要和自发性齿龈增生症相互鉴别。自发性齿龈增生症为遗传性疾病，见于遗传性齿龈纤维瘤病、结节性硬化症等。多于幼儿时开始发病，在齿龈上有弥漫性增生肥大，部分可覆盖牙齿。有些药物可以引起齿龈增生，例如治疗癫痫的苯妥英钠，长期服用后齿龈增生，在牙根处齿龈肥大、增生。