顽固性头痛一般是很容易诊断的，在鉴别诊断上要注意与脑占位性病变头痛、癫痫头痛、颈椎疾病(如椎动脉压迫、椎基底动脉供血不足)头痛进行鉴别，必要时可以行CT了解病情。脑膜癌(癌性脑膜炎)早期也表现顽固性头痛，由于病灶隐蔽而容易误诊为偏头痛。 患者自觉症状即可诊断。