因蛋白质明显缺乏出现水肿的患儿，应与心脏、肾脏病性水肿、结核性腹膜炎、肝硬化所致的腹水，以及过敏性水肿、以及脂肪摄入不足导致的营养不良等相鉴别。蛋白质营养不良具有明显的消瘦、肌肉组织明显减少，体格发育迟缓，通过详尽询问病史以及是否有单纯的米汤、米糊喂养史都不难与其他原因引起的营养不良性疾病相鉴别。
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