青霉菌广泛存在于自然界。某些青霉菌可产生抗生素如青霉素及多种酶和有机酸，从而得到广泛应用，多数通常为污染菌，少数菌种在一定条件下可引起青霉菌病(penicilliosis)和肺青霉病。近年来受到重视的马尔尼菲青霉菌病已在另一节重点讨论。
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