鉴别诊断首先与小螺菌鼠咬热（咬伤部位可出现炎症,并伴有回归热和区域性淋巴结炎，有时可出现玫瑰疹和荨麻疹样皮疹,但不及链杆菌性皮疹明显，全身症状常伴有发热）相区别，此外与其他原因引起的皮疹相鉴别，如风疹、败血症、流脑、过敏性紫癜及药物所引起的药物性皮疹等。哈佛希尔热还应与其他原因引起的腹泻、呼吸道感染相鉴别。
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