诊断热带性口炎性腹泻应与以下疾病鉴别：

1.肠道寄生虫病 如贾弟鞭毛虫、阿米巴等，大便虫卵检查及寄生虫检查有助于鉴别。

2.炎症性肠病 克罗恩病和溃疡性结肠炎均可出现吸收不良，但它们均有各自的X线特点。

3.麦胶引起的肠病 也可在热带发生。

4.维生素B12缺乏 B12缺乏也可以导致木糖吸收不良并引起空肠黏膜的不正常。治疗后可使吸收功能恢复，贫血纠正(B12治疗)有助于鉴别。