在美洲本病须与西方马脑炎、单纯疱疹性脑炎等鉴别诊断。
1.西方马型脑炎病程3～5天，大多在8～14天，成年人多无后遗症，乳幼儿后遗症常有智能低下，情绪不稳，四肢强直性瘫痪，老年患者则表现为精神障碍和人格改变。
2.单纯疱疹脑炎又称疱疹病毒性脑炎;既可见于初发性单纯疱疹病毒感染，也可见于复发性患者。本病呈散发性，在非流行性病毒脑炎中系最常见的一种，据统计约占病毒性脑炎的10%～20%，病情严重、预后较差。