本病虽有急性脑病各种临床表现，但根据其显著的肝功能异常，脑脊液无明显变化等，可与化脓性、结核性或病毒性脑膜炎脑炎区别，又根据本病肝功能虽异常但无黄疸，可与重症肝炎、肝性脑病相鉴别。某些遗传代谢病如尿素循环酶缺陷，有机酸尿症可酷似Reye综合征表现，可通过详细病史，针对代谢病的尿液筛查，以及遗传学诊断进行鉴别。
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