与先天性凝血因子缺乏性疾病及颅内感染性疾病相鉴别。迟发性新生儿出血症，大多首发表现为颅内出血，突然起病，但无明显感染中毒症状，贫血发展迅速而严重，加之给予维生素K后，病情好转，故可与颅内感染相鉴别。亦可根据病史，症状，体征及临床表现，实验室检查结果作出鉴别。
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