(一)呼吸道感染 起病较缓慢，症状较轻，无明显中毒症状。血清学和免疫荧光等检验可明确诊断。

(二)流行性脑脊膜脑炎(流脑) 流脑早期症状往往类似流感，但流脑有明显的季节性，儿童多见。早期有剧烈头痛、脑膜刺激症状、瘀点、口唇疱疹等均可与流感相鉴别。脑脊液检查可明确诊断。

(三)军团病 本病多见于夏秋季，临床上表现为重型肺炎，白细胞总数增高，并有肝、肾合并症，但轻型病例类似流感。红霉素、利福平和庆大霉素等抗生素对本病有效，确诊有助于病原学检查。

(四)支原体肺炎 支原体肺炎与原发性病毒性肺炎的X线表现相似，但前者的病情较轻，冷凝集试验和MG链球菌凝集试验可呈阳性。

(五)急性细菌性扁桃体炎 扁桃体红肿并有渗出。培养可能分离出致病菌。

(六)钩端螺旋体病 有一定地区性，多发生于收割水稻季节，农民多见，有腓肠肌疼痛、压痛或腹股沟淋巴结肿大压痛等为鉴别要点。