人体如果３－４个月不供应维生素Ｂ２就可以观察到单纯维生素Ｂ２缺乏的症状，呈现特殊的上皮损害、脂溢性皮炎、轻度的弥漫性上皮角化病伴有脂溢性脱发和神经紊乱。同时机体中有些黄素酶的活性异常降低，其中最明显的是红细胞内骨胱甘肽还原酶，此酶是体内维生素Ｂ２营养状况的标志。维生素Ｂ２缺乏主要表现在，眼、口、唇、舌、皮肤、和粘膜的变化。

眼部，球结膜充血、角膜血管增生，角膜与结膜相连处有时发生水泡。严重时角膜下部有溃疡，发生睑缘炎、怕光、流泪与食物模糊。老年白内障与维生素Ｂ２缺乏有关。

口，口角湿白、裂隙、、溃疡、唇肿胀、裂隙与溃疡以及色素沉着；舌疼痛、肿胀、红斑、乳头萎缩，典型者舌称紫红色，火红次相见，中央红斑，边缘界线清楚如地图。

皮肤，脂溢性皮炎常见于皮质分泌旺盛部位，如鼻唇沟、下颌、眉间、耳后、乳房下、腋下、腹股沟等处。患处皮肤皮脂增多，轻度红斑，有脂状黄色鳞片。男性多见于阴囊，且常有渗液、脱屑、结痂、皮肤变色等，女性也偶见此变化于阴唇。

贫血，维生素Ｂ２缺乏场干扰铁的吸收、储存、动员，使铁量减少严重可造成贫血。

其他，维生素Ｂ２缺乏还影响生长发育，妊娠期缺乏可致胎儿畸形。